在处理论文查重报告中的常见问题时，首先要注意文献引用格式的规范性。确保文中引用的资料准确无误，避免因引用格式错误而被查重系统误判为抄袭。其次，关注论文中重复率较高的部分，对于一些常见词汇或短语可以适当进行替换或重构，以降低重复率。同时，及时保存论文的草稿版本，以备查重时进行比对。最后，查重报告中若出现与其他文献相似度过高的情况，可通过添加更多自己的见解和分析来提高原创性，避免被认定为抄袭。

另外，在处理论文查重报告中的常见问题时，还需留意论文结构的合理性。确保论文的引言、正文和结论部分内容连贯，逻辑清晰，避免出现段落之间内容重复或错乱的情况。同时，注意论文中使用的图片、表格等资料是否标注清晰，避免因资料来源不明确而被查重系统误判。此外，定期对论文进行自查，发现问题及时修改，以确保最终提交的论文通过查重并获得认可。